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“基因组与生物信息学”暑期学习班
前 言:
华大基因自1999年成立以来,先后高效率、高质量的完成了国际人类基因组计划“中国卷”(1%)、国际人类单体型图计划(10%)、水稻基因组计划、家蚕基因组计划、家鸡基因组计划、抗SARS研究、炎黄一号等多项具有国际先进水平的科研工作,为中国和世界基因组科学的发展做出了突出贡献,奠定了中国基因组科学在国际上的领先地位,在《Nature》和《Science》等国际一流的杂志上发表多篇论文;同时建立了大规模测序、生物信息、克隆、基因与健康等技术平台,其测序能力及基因组分析能力位居世界前列。
为更好的推动基因组学及生物信息学在高校中的普及和发展,让广大在校大学中在最短的时间内高效的掌握基因组及生物信息学前沿进展及先进技术,为将来的科学研究工作奠定扎实的基础,华大基因特举办“基因组及生物信息学”暑期班,面向全国生物、医学、数学、物理及计算机学的对此领域内有兴趣有志向的广大在校大学生。
暑期学习班以知识传授及思维开拓为主,成绩优秀者不仅可以减免全部学习费用,并有机会加盟华大,投身于基因组学技生物信息学,而且有机会在我们的联合办学伙伴香港中文大学、华南理工大学、香港大学及丹麦哥本哈根大学等学校继续学习深造。
暑期班内容:
一、理论知识学习:
1. 基因组学前沿进展
2. 基因组学核心技术
3. 生物信息学核心研究内容及技术
4. 生物信息学与分子进化
5. 生物信息学与分子育种
6. 生物信息学与代谢综合症
7. 生物信息学与肿瘤研究
二、生物学实验
1. 基因组、转录组文库制备技术
2. 新一代大规模测序技术
三、上机实践:
基因组学、转录组学和生物信息学数据分析和实践:
1. 计算环境建设,Linux操作系统,Perl语言
2. 生物信息学常用数据库
3. 大规模基因组的序列拼接组装及注释
4. 比对分析
5. 转录组数据的分析和挖掘
6. SNP分析
7. 分子进化树构建
四、论文阅读与写作实践
1. 科学文献阅读
2. 论文写作
五、素质拓展训练:
1. 挑战自我
2. 团队合作
3. 思维开拓
专家队伍:
杨焕明:基因组学家,博士生导师,深圳华大基因研究院荣誉董事,中国科学院院士
1988年获丹麦哥本哈根大学博士学位,先后在法国马赛免疫中心、美国哈佛大学和UCLA等单位的基因组研究中心工作。1994年回国任中国医学科学院教授,1995年获全国杰出青年基金。1997年受聘为丹麦ARHUS大学客座教授。1998年受聘为中国科学院遗传所教授及人类基因组中心主任,是中国1%人类基因组测序任务的主要负责人。此外他还带领团队创建了“北京华大基因研究中心”,为我国的水稻、家蚕等大型基因组以及“非典”病毒等微生物基因组的研究做出了重大贡献。2006年荣获何梁何利科学与技术进步奖; 2007年当选中国科学院院士;2008年当选发展中国家科学院院士。
研究方向:基因组学,遗传学。
王 俊:教授,博士生导师,深圳华大基因研究院常务副院长,丹麦奥胡斯大学人类遗传学研究所/南丹麦大学人类遗传学生化及分子生物学系、北京大学生命科学学院客座教授
2002年获得北京大学生物信息学博士学位。1999年至今从事基因组学,生物信息学研究,组织实施了家蚕、家鸡、家猪、水稻、炎黄等多个重大基因组计划,在基因组组装,基因注释,比较基因组,基因进化,表达分析等方面取得多项研究成果,有多篇论文发表在“Nature”,“Science”等国际顶尖杂志上。2008年获国家杰出青年基金,先后获得“中国科学院杰出科技成就奖”,“中丹合作科学奖”,“新世纪百千万人才工程国家级人选”,“中国科学院重大创新贡献奖”等多项荣誉。
研究方向:基因组学,生物信息学。
李松岗:教授,博士生导师,深圳华大基因研究院副院长
1984年毕业于北京大学生物系,曾任北京大学生命科科学院副院长。从事生物信息学研究工作多年,曾参与水稻基因组测序、拼接、信息学分析工作,对完成水稻基因组项目做出重要贡献,还作为家蚕,家鸡,炎黄计划等多个项目生物信息主要负责人,指导完成多个项目的基因组生物信息学分析。拥有丰富的教学和科研工作经验,从教二十多年来先后指导过10名博士生、6名硕士生。在国际知名期刊上发表的学术论文共二十余篇,2002年出版的学术专著《实用生物统计学》被评为北京市精品教材。
研究方向:生物统计学、生物信息学。
王 文:研究员,博士生导师,中国科学院昆明动物所研究员、副所长,中德昆明动物所马普进化基因组学实验室主任,细胞与分子进化重点实验室常务副主任
1996年在昆明动物研究所获得博士学位。1997年至2002年美国芝加哥大学生态与进化学系博士后暨研究助理。2004获得国家杰出青年基金并入选国家 “新世纪百千万人才工程国家级首批入选者”。2005年始任中国科学院昆明动物研究所副所长。2007年作为首席科学家获得了“973”项目的支持。近年在基因的进化和起源这一重大科学问题上取得了一批重要结果并将此研究推到了一个新高度。目前已分别在《Science》、《Nature Genetics》、《Nature》、《Nature Review Genetics》等一系列重要学术杂志上发表多篇论文。
研究方向:进化学基因组学。
黄三文:教授,研究员,分子遗传课题组组长,中国农业科学院蔬菜花卉所学术委员会委员
1996-2000年,任中国农业科学院蔬菜花卉研究所助理研究员,2000-2005年赴荷兰瓦赫宁根大学,获得植物遗传育种博士学位。此后任中国农业科学院蔬菜花卉研究所生物技术室功能基因课题组组长,南京农业大学、中国农业科学院博士生导师,属中国农业科学院二级杰出岗位人才。致力于各类蔬菜花卉尤其是茄科、葫芦科作物的基因组科学研究,2002-2006年间,先后出席多个国际性茄科作物学术大会并发言。全国青联留学联谊会农业秘书长、中国院系学会终身会员,荷兰华人生命科学网发起人之一。已在国内外多家知名学术期刊发表十余篇论文。
研究方向:蔬菜作物生物技术,分子遗传及其应用研究。
此外,我们另将安排十名左右具有丰富的基因组学及生物信息学项目经验的科技工作者进行授课及随课指导。
主办单位:
深圳华大基因研究院
详情请浏览:www.genomics.org.cn
上课时间:2009年7月20日-8月20日
上课地点:深圳华大基因研究院
报名截止日期:2009年6月15日
报名方式:
申请者请将申请材料(详见奖学金申请办法及报名表)以电子邮件的方式寄到train@genomics.org.cn。为保证教学质量,我们会将人数控制在60人以内,按报名先后顺序筛选,有意者请尽快申请。我们会认真评审申请材料,于6月30日前通知入选的学员名单,同时附上详细课程安排。
学杂费:6000元,含食宿费。可申请全额奖学金覆盖此费用。未申请到奖学金的自费参加者,学期结束时,经考核成绩优秀者也可减免全部费用。
奖学金申请办法:
我们将在全国主要高校严格甄选60名左右大二、大三的本科生参加这次暑期班。申请的同学必须热爱生命科学,对基因组学、生物信息学等有关学科有浓厚兴趣。经正式入选的学员,我们将免去全部学费及资料费,并提供在深圳学习期间的食宿费用。更有获得加盟华大及继续学习的机会。参加申请者必须提交报名表内信息及材料(最好是英语)。